به منظور ارتقاء سطح علمی مراکز آموزش پزشکی و تقویت انگیزه پژوهش، مرکز تحقیقات بهداشت باروری و مشاوره در مامایی در تاریخ  ۲۴/۲/۱۳۹۲ مورد موافقت داخلی قرار گرفت. در این راستا اساسنامه حاضر براساس اهداف این مرکز تنظیم شد.

۱. بهره‌گیری از دانش، فناوری‌ها و دستاوردهای نوین علمی و انجام، حمایت و هدایت پژوهش‌های بنیادی، کاربردی، بالینی و بین‌رشته‌ای در زمینه سلامت جنسی-باروری، متناسب با اولویت‌های سلامت منطقه و کشور.
۲. شناسایی، بررسی و پایش عوامل مؤثر بر سلامت جنسی- باروری زنان و مردان، از جمله عوامل زیستی، محیطی، تغذیه‌ای، اجتماعی، فرهنگی، اقتصادی و روان‌شناختی و انجام مطالعات مرتبط با سلامت جنسی-باروری در مراحل مختلف زندگی، از جمله پیش از بارداری، بارداری، زایمان و پس از زایمان و نیز باروری و ناباروری و سلامت جنسی، در چارچوب قوانین و ضوابط کشور.
۳. شناسایی و تعیین اولویت‌های پژوهشی حوزه سلامت جنسی- باروری بر اساس نیازهای سلامت جامعه، شواهد علمی و سیاست‌های نظام سلامت و هدایت فعالیت‌های پژوهشی مرکز در این راستا.
۴. جمع‌آوری، ثبت، سازمان‌دهی، طبقه‌بندی و تحلیل اطلاعات، اسناد و داده‌های مرتبط با سلامت جنسی- باروری و ایجاد و توسعه پایگاه‌های اطلاعاتی و نظام‌های ثبت پژوهشی، در چارچوب قوانین و مقررات توسط طرحهای تحقیقاتی
۵. تولید، توسعه، انتقال و کاربرد دانش حاصل از پژوهش‌ها در برنامه‌ریزی، سیاست‌گذاری و ارتقای خدمات سلامت جنسی- باروری و مشارکت در تدوین و به‌روزرسانی راهنماها، دستورالعمل‌ها و برنامه‌های علمی مرتبط.
۶. انجام مطالعات و پژوهش‌های مرتبط با کیفیت، دسترسی، اثربخشی و کارایی خدمات سلامت جنسی- باروری و بررسی ابعاد اجتماعی، فرهنگی، اقتصادی و روان‌شناختی مؤثر بر سلامت باروری و ارائه راهکارهای مبتنی بر شواهد.
۷. انتشار و اشاعه نتایج و دستاوردهای پژوهشی مرکز در مجلات و منابع علمی معتبر و ارائه خدمات مشاوره‌ای و علمی در زمینه طرح، اجرا، تحلیل و انتشار تحقیقات مرتبط با اهداف مرکز، مطابق ضوابط و مقررات. با برگزاری کنگره های سالانه ملی و بین المللی تحت عنوان سلامت جنسی- باروری و مشاوره در مامایی
۸. توسعه همکاری‌های علمی، پژوهشی و آموزشی با دانشگاه‌ها، مراکز تحقیقاتی، آموزشی، بهداشتی و درمانی و سازمان‌های ذی‌ربط داخلی با رعایت قوانین و مقررات.
۹. انجام سایر فعالیت‌های علمی، پژوهشی و آموزشی مرتبط با اهداف و مأموریت مرکز، در چارچوب قوانین و مقررات وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی و دانشگاه  

الف- رئیس مرکز

ب- شورای پژوهشی مرکز

ج- معاون پژوهشی مرکز

د- اعضای مرکز تحقیقات

- اعضای شورای پژوهشی مرکز شامل ۱۱ تا۱۵ نفر از اعضای هیأت علمی از گروه­های (مدیریت سلامت ، اپیدمیولوژی و آمار زیستی، بهداشت وپزشکی اجتماعی ، و سایر گروه ها) هستند.

الف- تصویب اهداف پژوهشی مرکز
ب- تصویب طرح­های تحقیقاتی و گزارش نهایی طرح­های تحقیقاتی مرتبط
ج- بررسی و تصویب گزارش­های سالیانه فعالیت­های مرکز
د- تدوین و تصویب محورها و برنامه کنگره های سالانه ملی و بین المللی تحت عنوان سلامت جنسی- باروری و مشاوره در مامایی
هـ- تصویب سیاست­های انتشاراتی مرکز شامل چاپ کتاب، مقالات، نشریات علمی، برگزاری کنگره و شرکت در سمینارهای مرتبط

تبصره(۱)- جلسات شورای پژوهشی مرکز با حضور ۵۰% از اعضای شورای پژوهشی مرکز تشکیل خواهد شد.
تبصره(۲)- مصوبات شورای پژوهشی مرکز براساس سیاست­ها و خط مشی و هماهنگی با معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه هستند.

الف- سرپرست مرکز بالاترین مقام اجرایی مرکز است که با رأی اعضای شورای پژوهشی مرکز انتخاب و با ابلاغ سرپرست معاونت تحقیقات و فناوری به مدت ۴ سال تعیین می­گردد.
قابل ذکر است که انتخاب مجدد رئیس مرکز با رأی مجدد اعضا جهت دوره­های بعدی بلامانع است.

الف ) اعضاء موسس : اعضاء هیات علمی تمام وقت مرکز هستند
ب ) اعضاء پژوهشی : اعضاء هیات علمی با ابلاغ دوسالانه معاونت محترم تحقیقات و فن آوری هستند

الف- سرپرست مرکز به عنوان رئیس شورای پژوهشی مرکز
ب- معاونت پژوهشی مرکز به عنوان دبیر شورای پژوهشی مرکز
ج-۱۵-۱۱ نفر از اعضاء هیأت علمی مرکز یا محققینی که با آن مرکز همکاری دارند با انتخاب رئیس مرکز
تبصره- معاون پژوهشی مرکز توسط رئیس مرکز انتخاب می­شود و مسؤول هماهنگی و نظارت بر امور تحقیقاتی و بخش­های پژوهشی خواهد بود.

اعضاء شورای پژوهشی مرکز مسؤولیت برنامه­ریزی و تعیین سیاست­های پژوهشی مرکز را داشته و بررسی پروپوزال­ها و تصویب نهایی از وظایف این شورا است.